66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0201 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
402 aa  768    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  67.25 
 
 
427 aa  464  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  30.36 
 
 
444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  30.12 
 
 
445 aa  133  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  26.34 
 
 
454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
457 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
453 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
446 aa  93.6  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  25.68 
 
 
480 aa  93.6  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
446 aa  93.2  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  26.3 
 
 
459 aa  92.8  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  26.3 
 
 
459 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  33.24 
 
 
482 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  28.72 
 
 
470 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  22.03 
 
 
422 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  26.48 
 
 
476 aa  87  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  26.11 
 
 
474 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  25.32 
 
 
468 aa  86.7  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  26.11 
 
 
474 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  26.49 
 
 
495 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  27.35 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
513 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  25.65 
 
 
474 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 
471 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  25.45 
 
 
471 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  25.45 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  25.45 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  26.84 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  23.21 
 
 
450 aa  80.1  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 
457 aa  79  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  25.2 
 
 
504 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  26.49 
 
 
461 aa  76.6  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  26.18 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  25.06 
 
 
491 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  23.25 
 
 
482 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
457 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  21.5 
 
 
531 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  26.45 
 
 
490 aa  57  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  20 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  26.64 
 
 
440 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  24.71 
 
 
438 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.67 
 
 
592 aa  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  26.35 
 
 
441 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33640  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.37 
 
 
575 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179116  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.18 
 
 
680 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  42.65 
 
 
535 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  21.92 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02560  multidrug resistance protein fnx1, putative  40.54 
 
 
578 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.777678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  22.31 
 
 
415 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  25.21 
 
 
409 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58666  MFS transporter  30.63 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210164  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.03 
 
 
575 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.62 
 
 
532 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.07 
 
 
538 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.62 
 
 
572 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.99 
 
 
567 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  26.61 
 
 
408 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 
439 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.12 
 
 
676 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.31 
 
 
526 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  24.93 
 
 
419 aa  42.7  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>