49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0184 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  100 
 
 		 470 aa  926    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  65.74 
 
 		 468 aa  608  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  49.79 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  58.4 
 
 		 397 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 504 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 454 aa  110  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 480 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  22.72 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 457 aa  97.1  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 445 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 		 531 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  28.41 
 
 		 461 aa  87  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  21.73 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 482 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  21.98 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  27.64 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  24.56 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  23.44 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  24.56 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  25.16 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  24.92 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  21.58 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  23.78 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 469 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 440 aa  53.5  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  24.69 
 
 		 403 aa  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 423 aa  47.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 421 aa  43.5  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>