36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1907 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  100 
 
 		 469 aa  951    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 457 aa  136  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 445 aa  93.2  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 		 446 aa  91.3  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  22.33 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 531 aa  73.2  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  23.18 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  20.85 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  26.76 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  26.81 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  20.51 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  20.82 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  21.54 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  20.53 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  23.42 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  20 
 
 		 450 aa  56.2  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  22.32 
 
 		 474 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 470 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 495 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  22.02 
 
 		 474 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 438 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  21.69 
 
 		 476 aa  47.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  21.86 
 
 		 468 aa  47.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  22.39 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  19.52 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  23 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  19.34 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 431 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>