62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3609 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  94.94 
 
 		 474 aa  907    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  89.81 
 
 		 472 aa  837    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 474 aa  951    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  99.16 
 
 		 474 aa  946    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  83.48 
 
 		 476 aa  778    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  89.6 
 
 		 471 aa  837    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  90.23 
 
 		 472 aa  842    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  98.1 
 
 		 495 aa  937    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  79.45 
 
 		 491 aa  750    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  90.02 
 
 		 472 aa  841    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  72.21 
 
 		 482 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 461 aa  183  6e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  31.35 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  32.22 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  27.74 
 
 		 490 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 462 aa  116  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 446 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 504 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 445 aa  97.1  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 482 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  25.76 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  21.9 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  25.08 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  20.95 
 
 		 468 aa  63.9  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  21.35 
 
 		 413 aa  53.5  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 		 457 aa  53.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  25 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 437 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 441 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 419 aa  47  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  22.39 
 
 		 469 aa  47  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 414 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  24.4 
 
 		 430 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 409 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>