80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0029 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 427 aa  828    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  67.76 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  26 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 480 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  21.22 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 482 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 513 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 457 aa  97.4  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 470 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  27.45 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 459 aa  91.3  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  25.31 
 
 		 468 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 450 aa  89.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 531 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  25.79 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  26.3 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  27.85 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  25.97 
 
 		 474 aa  67  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  27.85 
 
 		 474 aa  67  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  26.09 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  26.4 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  23.38 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  21.96 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 438 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  25 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 439 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  30 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.28 
 
 		 505 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  24.29 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.27 
 
 		 504 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 498 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0160  general substrate transporter  29.57 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  32.69 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  25.49 
 
 		 402 aa  43.1  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 389 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 		 455 aa  43.1  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>