91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1065 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 404 aa  783    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  21.89 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  22.25 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  21.99 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.46 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  23.21 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  23.27 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.68 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  21.67 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3966  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 1075 aa  66.6  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  26.36 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  23.12 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  21.61 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  21.41 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  23.8 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  22.84 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  21.25 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  22.07 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  23.18 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  21.88 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  21.43 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 445 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 416 aa  53.5  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  22.91 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  22.91 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  22.91 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  22.91 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  22.91 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  22.91 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  25.4 
 
 		 405 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4186  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 421 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0605238  normal  0.40114 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  21.26 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  23.66 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  22.17 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4647  hypothetical protein  29.45 
 
 		 441 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  21 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1180  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  21.26 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  21.59 
 
 		 660 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  21.59 
 
 		 660 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  21 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0136  major facilitator superfamily permease  19.95 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  22.01 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  21.39 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  21.26 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  21.83 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  21 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  21 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  20.9 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  20.68 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 426 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2720  drug:proton antiporter  30.57 
 
 		 337 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  20.84 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  20.84 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>