30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4647 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4647  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  832    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4186  major facilitator superfamily MFS_1  62.53 
 
 		 421 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0605238  normal  0.40114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  29.43 
 
 		 407 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  30.82 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 398 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 471 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  25.94 
 
 		 427 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 433 aa  49.7  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 468 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 433 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 		 445 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>