66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4618 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 412 aa  779    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 434 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4186  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0605238  normal  0.40114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  25.42 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  21.21 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  26.23 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4647  hypothetical protein  27.64 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  27.18 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 418 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.96 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  23.16 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  23.16 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  22.63 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  22.66 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.63 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  24.27 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  23.16 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  23.16 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  27.92 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  22.11 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  28.22 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  22.62 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  21.88 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  21.71 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  21.71 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.03 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  21.45 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  22.2 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  23.13 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 409 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  23.15 
 
 		 401 aa  46.6  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  23.15 
 
 		 401 aa  46.6  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  23.15 
 
 		 401 aa  46.6  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  19.37 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  25 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  21.81 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  19.55 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  23.11 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  21.51 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 406 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  20.83 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>