78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5777 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  802    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 		 410 aa  265  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 433 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 		 436 aa  249  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  43.15 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  41.71 
 
 		 419 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  37.85 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 449 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  30.71 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  30.53 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  29.08 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  32.11 
 
 		 189 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  26.33 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2901  hypothetical protein  31.21 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  25 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  24 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  26.44 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  35 
 
 		 466 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  26.93 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  24.65 
 
 		 405 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2918  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 445 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  25 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  23.88 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  30.53 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  23.24 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  22.22 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  30.46 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2587  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 382 aa  47.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  22.25 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  21.17 
 
 		 424 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  22.25 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  22.25 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 433 aa  46.6  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  21.43 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  21.43 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4647  hypothetical protein  35.09 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  24.55 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  21.07 
 
 		 424 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4261  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 416 aa  43.9  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.861934 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.49 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  22.47 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  22.03 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 403 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 405 aa  43.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  21.43 
 
 		 395 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>