32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2587 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2587  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 382 aa  729    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0417  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.117512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  24.76 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.81 
 
 		 424 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  25.21 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.07 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  23.2 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.44 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.61 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.89 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.51 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  25.46 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  21.33 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  22.75 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.14 
 
 		 471 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 435 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>