21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1642 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 460 aa  868    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 434 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  45.72 
 
 		 395 aa  251  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 429 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 433 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 410 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  25.12 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  33.88 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  29.43 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2901  hypothetical protein  30.66 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  26.24 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  28.48 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>