46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 414 aa  779    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 410 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 417 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  29.78 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 418 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  25.06 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  26.19 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  34.64 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  25.64 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  32.08 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.32 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4186  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0605238  normal  0.40114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  31.38 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 424 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  32.49 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  32.49 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  20.8 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  32.49 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4647  hypothetical protein  30.53 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.67 
 
 		 522 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1087  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 459 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  30.05 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>