20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4177 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  31.75 
 
 		 427 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 417 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  30.65 
 
 		 419 aa  71.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 433 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 409 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 410 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  34.64 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 429 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 408 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 395 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 418 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 412 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  25.28 
 
 		 415 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 433 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 434 aa  41.6  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.01 
 
 		 607 aa  41.2  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>