15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1180 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1180  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 418 aa  786    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3966  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 1075 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  22.38 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 416 aa  53.5  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  21.96 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  25.78 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>