50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2087 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 446 aa  891    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 446 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 469 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 504 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 462 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 450 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 480 aa  123  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  26.75 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  26.06 
 
 		 474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  25.69 
 
 		 474 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  25.97 
 
 		 474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  25 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 472 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  24.75 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  22.22 
 
 		 491 aa  103  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 459 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 513 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  29.36 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  30.14 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 471 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 482 aa  89.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  26.27 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  25.12 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  24.23 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 391 aa  46.6  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>