28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002915 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002915  permease  100 
 
 		 438 aa  876    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  53.62 
 
 		 413 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  49.43 
 
 		 450 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  51.96 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  46.36 
 
 		 437 aa  359  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 442 aa  348  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  43.82 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  38.9 
 
 		 439 aa  259  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  36.85 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  32.76 
 
 		 384 aa  192  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22060  hypothetical protein  33.87 
 
 		 430 aa  172  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.104249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  38.44 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  21.79 
 
 		 441 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  22.98 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  22.1 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  22.72 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  21.02 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 392 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  20.8 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>