More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3777 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3434  General substrate transporter  79.33 
 
 		 429 aa  669    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  100 
 
 		 430 aa  856    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4667  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  41.83 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.14 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0298  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.13 
 
 		 448 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  37.59 
 
 		 448 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  37.59 
 
 		 448 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  36.28 
 
 		 435 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2803  general substrate transporter  38.05 
 
 		 432 aa  286  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1770  major facilitator superfamily protein  40.74 
 
 		 433 aa  286  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  36.05 
 
 		 435 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  38.19 
 
 		 440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  39.06 
 
 		 440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.26 
 
 		 471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  38.8 
 
 		 440 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  39.06 
 
 		 441 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  38.8 
 
 		 440 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  37.29 
 
 		 439 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.28 
 
 		 439 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  38.8 
 
 		 440 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  38.64 
 
 		 441 aa  282  9e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  38.54 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.52 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.52 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3486  General substrate transporter  38.21 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  38.54 
 
 		 440 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0793  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3606  alpha-ketoglutarate permease  37.79 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1788  major facilitator transporter  40 
 
 		 433 aa  276  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3990  General substrate transporter  38.73 
 
 		 431 aa  275  9e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341407  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  37.99 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  37.23 
 
 		 439 aa  273  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  38.7 
 
 		 441 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0815  metabolite:proton symporter family protein  36.65 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  37.3 
 
 		 453 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2109  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.41 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23029  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2040  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.41 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1563  metabolite:proton symporter family protein  36.41 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780395  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0602  alpha-ketoglutarate permease  36.41 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2196  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.41 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0719  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.41 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0761  General substrate transporter  37.75 
 
 		 430 aa  265  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3751  alpha-ketoglutarate transporter  36.73 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.129946  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2946  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.77 
 
 		 454 aa  263  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  35.05 
 
 		 450 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  35.05 
 
 		 450 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  35.05 
 
 		 450 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.05 
 
 		 450 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  35.05 
 
 		 450 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  35.05 
 
 		 634 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0075  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  36.26 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7129  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1191  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 426 aa  252  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0421509  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  36.3 
 
 		 426 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  35.51 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 461 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4675  general substrate transporter  36.78 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0145765  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  39.53 
 
 		 435 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5622  General substrate transporter  36.36 
 
 		 435 aa  249  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  35.31 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0205  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.27 
 
 		 435 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261779  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.49 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5748  general substrate transporter  41.42 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3496  alpha-ketoglutarate transporter  34.53 
 
 		 426 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18040  dicarboxylate or citrate transporter (MFS superfamily)  36.41 
 
 		 456 aa  247  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3340  alpha-ketoglutarate transporter  35.64 
 
 		 426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1720  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.77 
 
 		 445 aa  246  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  37.92 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2848  alpha-ketoglutarate transporter  35.68 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2866  alpha-ketoglutarate transporter  35.45 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2982  alpha-ketoglutarate transporter  35.45 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1613  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  0.254519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  34.51 
 
 		 433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5228  General substrate transporter  36.8 
 
 		 451 aa  243  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2870  alpha-ketoglutarate transporter  35.45 
 
 		 433 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2764  alpha-ketoglutarate transporter  35.45 
 
 		 433 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 445 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  36.32 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1167  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 483 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181603  normal  0.0337638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  37.32 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  37.32 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 443 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  35.48 
 
 		 451 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  37.32 
 
 		 436 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_004310  BR1453  metabolite-proton symporter  34.87 
 
 		 441 aa  239  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  35.48 
 
 		 451 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 432 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  34.35 
 
 		 441 aa  239  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  34.62 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3111  general substrate transporter  34.11 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0621648  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0883  alpha-ketoglutarate transporter  34.52 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.103256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.84 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  33.95 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4754  citrate-proton symporter, (MFS_1)  35.12 
 
 		 434 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0236627  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  36.87 
 
 		 441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>