More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0793 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0793  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 434 aa  865    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1191  major facilitator superfamily MFS_1  68.26 
 
 		 426 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0421509  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7129  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0205  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.62 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261779  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1770  major facilitator superfamily protein  42.13 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  38.57 
 
 		 435 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  38.57 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3606  alpha-ketoglutarate permease  42.42 
 
 		 434 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.11 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  38.43 
 
 		 453 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  39.04 
 
 		 426 aa  286  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  37.5 
 
 		 440 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  37.74 
 
 		 441 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  37.74 
 
 		 440 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  37.5 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  37.26 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  37.5 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  37.5 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  37.26 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  37.5 
 
 		 440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.15 
 
 		 471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.47 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.47 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  37.41 
 
 		 430 aa  284  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.84 
 
 		 439 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2946  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.05 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3434  General substrate transporter  37.32 
 
 		 429 aa  276  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  38.21 
 
 		 448 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  38.21 
 
 		 448 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  36.58 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  37.15 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  37.15 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  37.15 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  37.15 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  37.15 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  37.56 
 
 		 634 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  35.28 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2803  general substrate transporter  40.75 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  36.69 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 461 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0815  metabolite:proton symporter family protein  36.63 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246218  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0075  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  36.13 
 
 		 437 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  38.9 
 
 		 451 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  38.9 
 
 		 451 aa  263  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1563  metabolite:proton symporter family protein  36.08 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1720  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.7 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317591  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0602  alpha-ketoglutarate permease  36.08 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0719  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.08 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3486  General substrate transporter  35.71 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2196  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.08 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2109  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.08 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23029  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2040  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.08 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  37.21 
 
 		 447 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1453  metabolite-proton symporter  37.2 
 
 		 441 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5228  General substrate transporter  37.73 
 
 		 451 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18040  dicarboxylate or citrate transporter (MFS superfamily)  37.3 
 
 		 456 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  34.94 
 
 		 434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3496  alpha-ketoglutarate transporter  37.7 
 
 		 426 aa  259  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2179  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3340  alpha-ketoglutarate transporter  37.24 
 
 		 426 aa  256  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.73 
 
 		 442 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  35.81 
 
 		 433 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3751  alpha-ketoglutarate transporter  37.56 
 
 		 436 aa  256  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.129946  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3990  General substrate transporter  37.26 
 
 		 431 aa  256  8e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341407  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3111  general substrate transporter  38.48 
 
 		 435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0621648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0761  General substrate transporter  37.12 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  37.71 
 
 		 438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  38.14 
 
 		 436 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  38.14 
 
 		 436 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  37.85 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4675  general substrate transporter  38.81 
 
 		 432 aa  252  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0145765  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 444 aa  252  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4754  citrate-proton symporter, (MFS_1)  34.82 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0236627  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.05 
 
 		 435 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 436 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  35.35 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1622  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.28 
 
 		 434 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.809849  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6792  General substrate transporter  36.32 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  34.79 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0298  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.52 
 
 		 448 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 436 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4667  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 433 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2866  alpha-ketoglutarate transporter  36.49 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2848  alpha-ketoglutarate transporter  36.49 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1863  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 430 aa  246  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175149  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2982  alpha-ketoglutarate transporter  36.49 
 
 		 433 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 447 aa  246  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1330  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.57 
 
 		 445 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.481806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2030  dicarboxylic acid transporter PcaT  35.36 
 
 		 434 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1513  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.82 
 
 		 434 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0817  dicarboxylic acid transporter PcaT  35.83 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0329012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1592  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.35 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.594462  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1688  alpha-ketoglutarate permease  35.83 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3834  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2764  alpha-ketoglutarate transporter  36.49 
 
 		 433 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>