More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0298 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0298  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 		 448 aa  905    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1788  major facilitator transporter  48.93 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158886  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4667  major facilitator transporter  45 
 
 		 433 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3434  General substrate transporter  39.38 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  38.13 
 
 		 430 aa  303  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0793  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  33.98 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  33.98 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3486  General substrate transporter  34.58 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.46 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.46 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.22 
 
 		 439 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.22 
 
 		 471 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1770  major facilitator superfamily protein  36.73 
 
 		 433 aa  243  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7129  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  33.73 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.45 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 441 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  31.52 
 
 		 440 aa  232  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  32.18 
 
 		 440 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  32.18 
 
 		 440 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  31.94 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  32.41 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1649  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  31.29 
 
 		 440 aa  231  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  31.47 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0205  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  33.89 
 
 		 435 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261779  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  33.65 
 
 		 440 aa  230  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2803  general substrate transporter  33.72 
 
 		 432 aa  230  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  33.81 
 
 		 441 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  31.53 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2946  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.73 
 
 		 454 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  31.94 
 
 		 440 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3751  alpha-ketoglutarate transporter  32.66 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.129946  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0075  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  32.68 
 
 		 437 aa  226  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  32.39 
 
 		 434 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  33.17 
 
 		 453 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1191  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 426 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0421509  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.69 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3990  General substrate transporter  34.52 
 
 		 431 aa  223  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341407  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  32.73 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  32.73 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  32.73 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  32.73 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  32.73 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  31.29 
 
 		 448 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  31.29 
 
 		 448 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0761  General substrate transporter  33.57 
 
 		 430 aa  220  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1720  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.8 
 
 		 445 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3606  alpha-ketoglutarate permease  33.1 
 
 		 434 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1563  metabolite:proton symporter family protein  34.12 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780395  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0602  alpha-ketoglutarate permease  34.12 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  32.48 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2040  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  34.12 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2196  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  34.12 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0719  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  34.12 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2109  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  34.12 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  33.48 
 
 		 634 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0815  metabolite:proton symporter family protein  32.8 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246218  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3958  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.17 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.698828  normal  0.0345957 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3844  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.17 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6792  General substrate transporter  33.5 
 
 		 468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377787  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  34.84 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5228  General substrate transporter  34.02 
 
 		 451 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1688  alpha-ketoglutarate permease  32.93 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0344  alpha-ketoglutarate permease  32.93 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1865  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  32.93 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1877  alpha-ketoglutarate permease  32.93 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0817  dicarboxylic acid transporter PcaT  32.93 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0329012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  32.45 
 
 		 433 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  33.89 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4754  citrate-proton symporter, (MFS_1)  32.69 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0236627  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3111  general substrate transporter  35.08 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0621648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2030  dicarboxylic acid transporter PcaT  32.69 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1453  metabolite-proton symporter  32.32 
 
 		 441 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4675  general substrate transporter  36.77 
 
 		 432 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0145765  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 461 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1018  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.94 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010389 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.2 
 
 		 435 aa  210  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4696  General substrate transporter  30.88 
 
 		 462 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  31.73 
 
 		 447 aa  209  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4306  dicarboxylic acid transport protein  32.9 
 
 		 433 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2179  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 458 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1622  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.45 
 
 		 434 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.809849  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1987  alpha-ketoglutarate/proton symporter  33.17 
 
 		 434 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.057402  normal  0.55373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4436  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.46 
 
 		 429 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.939154  hitchhiker  0.00699938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2254  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.1 
 
 		 434 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  33.33 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0588  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 464 aa  207  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 443 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  33.33 
 
 		 435 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2764  alpha-ketoglutarate transporter  32.11 
 
 		 433 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  33.49 
 
 		 454 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1513  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.72 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  33.6 
 
 		 435 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>