More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4667 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4667  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  862    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1788  major facilitator transporter  64.9 
 
 		 433 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158886  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0298  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45 
 
 		 448 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  41.06 
 
 		 430 aa  306  7e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3434  General substrate transporter  36.71 
 
 		 429 aa  272  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0793  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  35.36 
 
 		 435 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1770  major facilitator superfamily protein  37.2 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  35.13 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3751  alpha-ketoglutarate transporter  37.18 
 
 		 436 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.129946  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3606  alpha-ketoglutarate permease  36.07 
 
 		 434 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0075  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  33.49 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7129  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  35.63 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  35.63 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  35.63 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.63 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  35.63 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3496  alpha-ketoglutarate transporter  34.36 
 
 		 426 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2946  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.94 
 
 		 454 aa  223  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3340  alpha-ketoglutarate transporter  34.36 
 
 		 426 aa  222  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 433 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1649  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 425 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2848  alpha-ketoglutarate transporter  34.03 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  35.63 
 
 		 634 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2866  alpha-ketoglutarate transporter  33.8 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2982  alpha-ketoglutarate transporter  33.8 
 
 		 433 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1720  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.07 
 
 		 445 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  32.87 
 
 		 439 aa  219  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  35.05 
 
 		 426 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  33.72 
 
 		 441 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  33.49 
 
 		 441 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  33.49 
 
 		 440 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2764  alpha-ketoglutarate transporter  33.8 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  33.49 
 
 		 440 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  33.49 
 
 		 440 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2803  general substrate transporter  34.72 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0205  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  33.41 
 
 		 435 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261779  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0761  General substrate transporter  35.02 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2870  alpha-ketoglutarate transporter  33.8 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  33.26 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  33.42 
 
 		 434 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.53 
 
 		 430 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  33.26 
 
 		 440 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1453  metabolite-proton symporter  33.49 
 
 		 441 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.81 
 
 		 439 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.64 
 
 		 471 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  33.26 
 
 		 440 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.81 
 
 		 439 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 461 aa  216  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.81 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  33.57 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  34.44 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1191  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0421509  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5228  General substrate transporter  34.45 
 
 		 451 aa  213  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18040  dicarboxylate or citrate transporter (MFS superfamily)  34.73 
 
 		 456 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 447 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1513  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.81 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  34.15 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  34.15 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  34.46 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1531  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.81 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  34.2 
 
 		 451 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  34.2 
 
 		 451 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  33.73 
 
 		 441 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  32.2 
 
 		 433 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  35.75 
 
 		 439 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1622  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.88 
 
 		 434 aa  209  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.809849  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4754  citrate-proton symporter, (MFS_1)  33.65 
 
 		 434 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0236627  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3844  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.12 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2030  dicarboxylic acid transporter PcaT  34.4 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.87 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3958  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.12 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.698828  normal  0.0345957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0817  dicarboxylic acid transporter PcaT  34.4 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0329012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1877  alpha-ketoglutarate permease  34.4 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0344  alpha-ketoglutarate permease  34.4 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1865  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  34.4 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1688  alpha-ketoglutarate permease  34.4 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3834  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5495  citrate-proton symport  34.68 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0883  alpha-ketoglutarate transporter  32.65 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.103256  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2739  alpha-ketoglutarate transporter  33.33 
 
 		 432 aa  207  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.715904  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 444 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1018  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.98 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010389 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1592  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.33 
 
 		 434 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.594462  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1616  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.33 
 
 		 434 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1136  metabolite  33.33 
 
 		 434 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3823  alpha-ketoglutarate transporter  32.87 
 
 		 459 aa  206  9e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 425 aa  206  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02481  alpha-ketoglutarate transporter  32.87 
 
 		 432 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1081  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.87 
 
 		 432 aa  206  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0566171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02445  hypothetical protein  32.87 
 
 		 432 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2873  alpha-ketoglutarate transporter  32.87 
 
 		 432 aa  206  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.764755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1090  alpha-ketoglutarate transporter  32.87 
 
 		 432 aa  206  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153199  hitchhiker  0.00390378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02810  dicarboxylic acid transporter PcaT  34.48 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0897596  hitchhiker  0.00833984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>