More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1788 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1788  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  852    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158886  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4667  major facilitator transporter  67.31 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0298  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.93 
 
 		 448 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  40 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3434  General substrate transporter  38.26 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0075  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  36.62 
 
 		 437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  36.5 
 
 		 441 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  36.5 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  36.98 
 
 		 440 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  36.5 
 
 		 440 aa  249  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  36.5 
 
 		 440 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  36.5 
 
 		 440 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  36.78 
 
 		 440 aa  249  9e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  36.25 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  36.5 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0793  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 		 434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  36.21 
 
 		 439 aa  246  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  35.61 
 
 		 434 aa  243  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1770  major facilitator superfamily protein  38.37 
 
 		 433 aa  243  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1191  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 426 aa  243  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0421509  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  37.38 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  37.15 
 
 		 435 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3958  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.32 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.698828  normal  0.0345957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3340  alpha-ketoglutarate transporter  35.47 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3496  alpha-ketoglutarate transporter  36.16 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3844  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.32 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3751  alpha-ketoglutarate transporter  36.86 
 
 		 436 aa  236  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.129946  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2848  alpha-ketoglutarate transporter  36.01 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  34.9 
 
 		 453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2866  alpha-ketoglutarate transporter  36.09 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2982  alpha-ketoglutarate transporter  36.09 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 433 aa  232  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3606  alpha-ketoglutarate permease  37.59 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1649  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2870  alpha-ketoglutarate transporter  36.09 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2764  alpha-ketoglutarate transporter  36.09 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.52 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.52 
 
 		 439 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.42 
 
 		 442 aa  229  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.17 
 
 		 439 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1513  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.92 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1592  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.5 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.594462  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1616  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.5 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1136  metabolite  37.5 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.92 
 
 		 439 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4754  citrate-proton symporter, (MFS_1)  35.13 
 
 		 434 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0236627  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1531  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.92 
 
 		 434 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1622  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.75 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.809849  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 441 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  35.82 
 
 		 441 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2803  general substrate transporter  36.67 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  36.83 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  36.67 
 
 		 426 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5228  General substrate transporter  34.89 
 
 		 451 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.85 
 
 		 430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  33.49 
 
 		 448 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  33.49 
 
 		 448 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  34.58 
 
 		 451 aa  223  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  35.07 
 
 		 451 aa  222  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0883  alpha-ketoglutarate transporter  35.61 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.103256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1877  alpha-ketoglutarate permease  35.61 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1688  alpha-ketoglutarate permease  35.61 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1865  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.61 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0817  dicarboxylic acid transporter PcaT  35.61 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0329012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0344  alpha-ketoglutarate permease  35.61 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2030  dicarboxylic acid transporter PcaT  35.38 
 
 		 434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1987  alpha-ketoglutarate/proton symporter  36.32 
 
 		 434 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.057402  normal  0.55373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4696  General substrate transporter  35.71 
 
 		 462 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2739  alpha-ketoglutarate transporter  38.57 
 
 		 432 aa  219  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.715904  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2254  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.36 
 
 		 434 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7129  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 435 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3823  alpha-ketoglutarate transporter  38.08 
 
 		 459 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5495  citrate-proton symport  36.21 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02810  dicarboxylic acid transporter PcaT  35.84 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0897596  hitchhiker  0.00833984 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02481  alpha-ketoglutarate transporter  38.08 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1081  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.08 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0566171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02445  hypothetical protein  38.08 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1090  alpha-ketoglutarate transporter  38.08 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153199  hitchhiker  0.00390378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2873  alpha-ketoglutarate transporter  38.08 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.764755  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  34.11 
 
 		 444 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2177  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0315  dicarboxylic acid transporter PcaT  35.73 
 
 		 433 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3486  General substrate transporter  32.09 
 
 		 439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1018  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.39 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4306  dicarboxylic acid transport protein  35.66 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2946  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.44 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18040  dicarboxylate or citrate transporter (MFS superfamily)  34.86 
 
 		 456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.48 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1453  metabolite-proton symporter  35.34 
 
 		 441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  35.48 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  35.48 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0849  alpha-ketoglutarate transporter  36.09 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  35.48 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0205  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.34 
 
 		 435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261779  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  35.48 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  34.36 
 
 		 444 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  35.48 
 
 		 634 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>