More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1191 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1191  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 426 aa  829    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0421509  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0793  major facilitator superfamily MFS_1  67.76 
 
 		 434 aa  551  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7129  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0205  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.79 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261779  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3606  alpha-ketoglutarate permease  45.3 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  40.68 
 
 		 435 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  40.68 
 
 		 435 aa  302  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  41.02 
 
 		 426 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.34 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.29 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.29 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.29 
 
 		 471 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1770  major facilitator superfamily protein  43.69 
 
 		 433 aa  299  6e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 441 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  40.24 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  40.24 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  40.49 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  38.74 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  40.49 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  40.82 
 
 		 441 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  40.24 
 
 		 440 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  40.34 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  40.24 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  40.24 
 
 		 440 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  40 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  39.91 
 
 		 453 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18040  dicarboxylate or citrate transporter (MFS superfamily)  40.38 
 
 		 456 aa  282  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4675  general substrate transporter  41.43 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0145765  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  40.88 
 
 		 450 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  40.88 
 
 		 450 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  40.88 
 
 		 450 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  40.88 
 
 		 450 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  40.88 
 
 		 450 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0075  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  39 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.86 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.1 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  40.88 
 
 		 634 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3958  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.95 
 
 		 434 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.698828  normal  0.0345957 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3844  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.95 
 
 		 434 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  39.32 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  39.1 
 
 		 448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  39.1 
 
 		 448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2803  general substrate transporter  42.82 
 
 		 432 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  39.23 
 
 		 447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  37.41 
 
 		 439 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  38.97 
 
 		 433 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3486  General substrate transporter  39.18 
 
 		 439 aa  269  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1720  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.76 
 
 		 445 aa  269  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317591  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1453  metabolite-proton symporter  37.74 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2866  alpha-ketoglutarate transporter  39.43 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2848  alpha-ketoglutarate transporter  39.43 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2982  alpha-ketoglutarate transporter  39.43 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2764  alpha-ketoglutarate transporter  39.19 
 
 		 433 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2870  alpha-ketoglutarate transporter  39.19 
 
 		 433 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  38.31 
 
 		 451 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2946  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.24 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  38.31 
 
 		 451 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0719  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.17 
 
 		 439 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1563  metabolite:proton symporter family protein  36.17 
 
 		 439 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780395  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0602  alpha-ketoglutarate permease  36.17 
 
 		 439 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2040  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.17 
 
 		 439 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2196  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.17 
 
 		 439 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2109  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.17 
 
 		 439 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23029  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0815  metabolite:proton symporter family protein  36.65 
 
 		 439 aa  263  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246218  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3340  alpha-ketoglutarate transporter  39.81 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4306  dicarboxylic acid transport protein  38.97 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1531  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.12 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3496  alpha-ketoglutarate transporter  39.32 
 
 		 426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3751  alpha-ketoglutarate transporter  39.46 
 
 		 436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.129946  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1513  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.88 
 
 		 434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4754  citrate-proton symporter, (MFS_1)  38.82 
 
 		 434 aa  259  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0236627  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1622  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.73 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.809849  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1613  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 442 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  0.254519 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1688  alpha-ketoglutarate permease  39.02 
 
 		 434 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0817  dicarboxylic acid transporter PcaT  39.02 
 
 		 434 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0329012  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3990  General substrate transporter  39.29 
 
 		 431 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341407  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0344  alpha-ketoglutarate permease  39.02 
 
 		 434 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5228  General substrate transporter  38.28 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1863  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175149  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1592  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.07 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.594462  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1987  alpha-ketoglutarate/proton symporter  40.72 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.057402  normal  0.55373 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1136  metabolite  39.07 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1616  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.07 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0761  General substrate transporter  37.98 
 
 		 430 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1330  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.34 
 
 		 445 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.481806  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1877  alpha-ketoglutarate permease  39.08 
 
 		 434 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2030  dicarboxylic acid transporter PcaT  39.08 
 
 		 434 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1865  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  39.08 
 
 		 434 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5495  citrate-proton symport  40.77 
 
 		 437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  36.75 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3945  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.46 
 
 		 452 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5206  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.89 
 
 		 449 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0315  dicarboxylic acid transporter PcaT  37.91 
 
 		 433 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02810  dicarboxylic acid transporter PcaT  37.56 
 
 		 432 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0897596  hitchhiker  0.00833984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2950  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.89 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2254  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.14 
 
 		 434 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5906  alpha-ketoglutarate transporter  41.18 
 
 		 437 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.414704  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1649  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1272  citrate-proton symport  38.73 
 
 		 444 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>