More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3434 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  79.33 
 
 
430 aa  669    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3434  General substrate transporter  100 
 
 
429 aa  850    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0298  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.38 
 
 
448 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1770  major facilitator superfamily protein  42.34 
 
 
433 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.26 
 
 
430 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  40.19 
 
 
433 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  36.74 
 
 
435 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  36.28 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3606  alpha-ketoglutarate permease  39.01 
 
 
434 aa  273  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0793  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 
434 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  36.79 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  37.1 
 
 
440 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  36.61 
 
 
440 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  36.86 
 
 
441 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  36.61 
 
 
441 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  39 
 
 
441 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  36.61 
 
 
440 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  36.61 
 
 
440 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3486  General substrate transporter  38.13 
 
 
439 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4667  major facilitator transporter  37.4 
 
 
433 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207376  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.38 
 
 
439 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  36.36 
 
 
440 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  36.36 
 
 
440 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  36.12 
 
 
440 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.38 
 
 
439 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  39.25 
 
 
441 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  38.36 
 
 
448 aa  263  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  38.36 
 
 
448 aa  263  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.14 
 
 
471 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  37.11 
 
 
439 aa  262  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.14 
 
 
439 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2803  general substrate transporter  36.13 
 
 
432 aa  261  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  37.5 
 
 
453 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0761  General substrate transporter  36.58 
 
 
430 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1788  major facilitator transporter  38.26 
 
 
433 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3990  General substrate transporter  37.35 
 
 
431 aa  256  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341407  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  37.77 
 
 
435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  37.83 
 
 
447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 
443 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  36.34 
 
 
440 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0815  metabolite:proton symporter family protein  35.63 
 
 
439 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.69 
 
 
430 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0719  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.03 
 
 
439 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2040  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.03 
 
 
439 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1563  metabolite:proton symporter family protein  36.03 
 
 
439 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780395  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0602  alpha-ketoglutarate permease  36.03 
 
 
439 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2109  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.03 
 
 
439 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23029  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2196  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.03 
 
 
439 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  37.24 
 
 
436 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  37.24 
 
 
436 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  37.24 
 
 
436 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  37.8 
 
 
439 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  33.65 
 
 
440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  35.77 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  35.77 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  35.77 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  35.77 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.93 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.77 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  33.33 
 
 
458 aa  243  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  34.09 
 
 
461 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.08 
 
 
442 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  33.88 
 
 
453 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  35.77 
 
 
634 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
430 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2946  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.56 
 
 
454 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200417  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  34.91 
 
 
431 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  32.25 
 
 
460 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  32.25 
 
 
460 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  32.25 
 
 
460 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
443 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  35.42 
 
 
426 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1191  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 
426 aa  239  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0421509  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1649  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 
425 aa  239  8e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  33.17 
 
 
445 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  34 
 
 
447 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  36.34 
 
 
454 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4675  general substrate transporter  36.71 
 
 
432 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0145765  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  37.2 
 
 
434 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  33.1 
 
 
435 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  33.1 
 
 
435 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  32.55 
 
 
430 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  37.26 
 
 
441 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5622  General substrate transporter  36.87 
 
 
435 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335897  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0075  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  35.75 
 
 
437 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  34.66 
 
 
438 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  38.06 
 
 
451 aa  236  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5748  general substrate transporter  38.13 
 
 
441 aa  236  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  38.06 
 
 
451 aa  236  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  32.31 
 
 
430 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  32.31 
 
 
430 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  35.73 
 
 
436 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  32.31 
 
 
430 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  32.71 
 
 
430 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  32.71 
 
 
430 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  33.74 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  35.34 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  34.66 
 
 
438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  33.82 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  35.17 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>