43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4648 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  785    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 
395 aa  345  6e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  41.81 
 
 
399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  43.61 
 
 
398 aa  287  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  29.26 
 
 
396 aa  182  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 
378 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  28.42 
 
 
382 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  27.91 
 
 
380 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
398 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  31.16 
 
 
383 aa  123  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  28.18 
 
 
401 aa  122  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  26.87 
 
 
411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  29.85 
 
 
392 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
388 aa  119  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  30.45 
 
 
395 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  30.03 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  28.39 
 
 
393 aa  116  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  27.25 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
409 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  28.65 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  28.34 
 
 
402 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
398 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  28.03 
 
 
393 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  28.34 
 
 
430 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
402 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  28.04 
 
 
412 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  28.1 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  29.08 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  26.35 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  28.54 
 
 
396 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  29.72 
 
 
396 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  26.9 
 
 
401 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  27.03 
 
 
401 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  28.45 
 
 
388 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  27.25 
 
 
407 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  27.7 
 
 
410 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  28.89 
 
 
397 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  25.91 
 
 
415 aa  106  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  27.6 
 
 
405 aa  96.7  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
388 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  22.73 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3883  FkbM family methyltransferase  29.27 
 
 
228 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal  0.0192927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>