42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1098 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 409 aa  820    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  67.73 
 
 		 415 aa  567  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  71.74 
 
 		 411 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  56.51 
 
 		 393 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  55.06 
 
 		 392 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  55.73 
 
 		 393 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  53.63 
 
 		 402 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  51.92 
 
 		 412 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  53.37 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  53.37 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  53.11 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  50.77 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  52.06 
 
 		 401 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  51.43 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  51.57 
 
 		 388 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  50.39 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  52.62 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  52.47 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  52.47 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  50.39 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  51.04 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  50.13 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  50.92 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  45.12 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  44.22 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 383 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  40 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 		 378 aa  280  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  39.51 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 398 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  39.36 
 
 		 388 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  28.57 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  27.89 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  26.68 
 
 		 398 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  25.41 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>