43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2047 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  96.23 
 
 		 398 aa  756    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 398 aa  802    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  59.37 
 
 		 388 aa  472  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  48.7 
 
 		 385 aa  398  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  49.21 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  48.53 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 388 aa  358  7e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 382 aa  353  2e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 380 aa  348  9e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 412 aa  269  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  39.4 
 
 		 401 aa  268  8.999999999999999e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  38.48 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  38.21 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  40.22 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  41 
 
 		 430 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 395 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 391 aa  252  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  37.89 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 407 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 409 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 411 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  28.94 
 
 		 399 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  27.42 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  24.79 
 
 		 396 aa  119  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  28.08 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>