42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0120 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  100 
 
 		 397 aa  794    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  66.49 
 
 		 396 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  65.62 
 
 		 410 aa  522  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  64.4 
 
 		 395 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  64.46 
 
 		 407 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  64.74 
 
 		 388 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  64.47 
 
 		 396 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  65.08 
 
 		 402 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  65.44 
 
 		 412 aa  501  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  61.46 
 
 		 393 aa  494  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  64.81 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  63.14 
 
 		 430 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  63.02 
 
 		 391 aa  497  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  65.08 
 
 		 402 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  63.19 
 
 		 401 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  63.87 
 
 		 401 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  64.02 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  58.7 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  59.27 
 
 		 393 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  53.83 
 
 		 405 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  57.07 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  50.78 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 		 409 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  49.1 
 
 		 411 aa  350  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 415 aa  348  7e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 380 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  44.74 
 
 		 385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  44.32 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  45.25 
 
 		 388 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  42.7 
 
 		 383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  44.89 
 
 		 378 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  41.67 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  41.24 
 
 		 398 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  28.21 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  27.61 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  25.19 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  28.13 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1437  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.483807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>