41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0869 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  800    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  36.05 
 
 
399 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  29.01 
 
 
396 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  33.43 
 
 
398 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
409 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  24.8 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  24.25 
 
 
382 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  26.89 
 
 
383 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  25.19 
 
 
415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  27.98 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  26.53 
 
 
407 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  25.91 
 
 
391 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  26.22 
 
 
388 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  27.78 
 
 
398 aa  123  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
385 aa  123  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  24.43 
 
 
411 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  27.43 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
378 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  24.65 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  28 
 
 
393 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  26.13 
 
 
401 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  25.19 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  24.66 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  26.16 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  26.34 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  28.25 
 
 
393 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  25.47 
 
 
402 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  25.47 
 
 
402 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  25.61 
 
 
401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  25.26 
 
 
430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  24.94 
 
 
401 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  24.73 
 
 
392 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  25.07 
 
 
410 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  26.15 
 
 
401 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  24.81 
 
 
405 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 
398 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 
388 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>