42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0789 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  80.71 
 
 
401 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  81.33 
 
 
402 aa  644    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  83.2 
 
 
396 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  90.18 
 
 
396 aa  699    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  81.59 
 
 
402 aa  646    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  100 
 
 
395 aa  793    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  81.07 
 
 
402 aa  644    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  81.72 
 
 
388 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  81.33 
 
 
430 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  79.95 
 
 
401 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  81.22 
 
 
401 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  76.84 
 
 
407 aa  619  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  75.06 
 
 
412 aa  608  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  77.69 
 
 
391 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  64.91 
 
 
410 aa  528  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  64.4 
 
 
397 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  60 
 
 
393 aa  472  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  59.21 
 
 
392 aa  467  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  57.89 
 
 
393 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  56.99 
 
 
405 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  61.31 
 
 
401 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  52.83 
 
 
398 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 
409 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  49.74 
 
 
415 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  51.05 
 
 
411 aa  358  8e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  46.09 
 
 
385 aa  328  9e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  45.94 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  42.97 
 
 
382 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  42.97 
 
 
380 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  44.51 
 
 
388 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  44.38 
 
 
383 aa  297  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  42.4 
 
 
378 aa  296  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  41.78 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 
388 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 
398 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 
398 aa  236  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  30.32 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  28.76 
 
 
399 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  24.66 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  29.95 
 
 
396 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
430 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>