42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0141 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  832    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  64.91 
 
 		 395 aa  528  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  67.72 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  67.37 
 
 		 407 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  66.32 
 
 		 402 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  65.62 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  65.89 
 
 		 430 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  66.32 
 
 		 402 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  66.32 
 
 		 402 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  66.93 
 
 		 401 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  67.02 
 
 		 401 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  65.45 
 
 		 388 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  66.49 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  66.14 
 
 		 401 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  66.23 
 
 		 391 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  65.16 
 
 		 412 aa  501  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  58.96 
 
 		 392 aa  484  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  59.59 
 
 		 393 aa  484  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  59.22 
 
 		 393 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  61.88 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  53.7 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  48.43 
 
 		 409 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 411 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  47.41 
 
 		 415 aa  356  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  43.87 
 
 		 385 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  44.93 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  44.8 
 
 		 388 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  45.13 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 383 aa  290  3e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  40.05 
 
 		 391 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 		 398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  26.14 
 
 		 399 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  27.44 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  25.07 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  26.98 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 376 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>