41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001239 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001239  permease  100 
 
 		 393 aa  782    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  92.62 
 
 		 393 aa  719    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  76.84 
 
 		 392 aa  631  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  61.46 
 
 		 397 aa  494  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  59.59 
 
 		 410 aa  484  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  61.3 
 
 		 402 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  61.04 
 
 		 402 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  61.3 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  61.3 
 
 		 402 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  60.85 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  60 
 
 		 395 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  61.04 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 407 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  60.69 
 
 		 401 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  60.36 
 
 		 412 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  60.69 
 
 		 401 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  59.21 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  60.32 
 
 		 401 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  59.32 
 
 		 391 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  59.9 
 
 		 411 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  57.26 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  59.79 
 
 		 401 aa  438  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  56.51 
 
 		 409 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  56.48 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  54.17 
 
 		 415 aa  411  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  46.38 
 
 		 385 aa  324  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  44.93 
 
 		 396 aa  306  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  44.97 
 
 		 388 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  42.51 
 
 		 391 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 		 398 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 		 388 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 398 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  27.6 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  29.27 
 
 		 398 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  28 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  28.03 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>