41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05106 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001239  permease  92.62 
 
 
393 aa  739    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  782    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  76.73 
 
 
392 aa  627  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  59.22 
 
 
410 aa  481  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  59.27 
 
 
397 aa  481  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  59.37 
 
 
402 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  59.37 
 
 
402 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  59.1 
 
 
402 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  59.37 
 
 
430 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  58.99 
 
 
396 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  59.21 
 
 
396 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  57.89 
 
 
395 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  59.52 
 
 
412 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  58.25 
 
 
401 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  58.36 
 
 
407 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  58.01 
 
 
391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  57.47 
 
 
401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  58.14 
 
 
401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  56.58 
 
 
388 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  59.64 
 
 
411 aa  441  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  56.46 
 
 
405 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  58.54 
 
 
401 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  55.73 
 
 
409 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  54.95 
 
 
415 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  55.09 
 
 
398 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  46.63 
 
 
385 aa  320  3e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  44.57 
 
 
380 aa  319  7e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  44.14 
 
 
382 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  43.63 
 
 
383 aa  301  1e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  44.69 
 
 
388 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  44.27 
 
 
378 aa  297  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  43.56 
 
 
396 aa  296  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  41.69 
 
 
391 aa  276  6e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 
388 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 
398 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
395 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  28.14 
 
 
399 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  29 
 
 
398 aa  132  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  28.25 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  29.46 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>