51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2829 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  790    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  61.25 
 
 		 378 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  57.44 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  55.85 
 
 		 385 aa  444  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  57.18 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  53.32 
 
 		 388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  49.21 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  49.21 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  46.09 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  45.94 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 		 402 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 402 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 430 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  45.6 
 
 		 401 aa  322  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 412 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  44.22 
 
 		 409 aa  319  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 401 aa  319  7e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 401 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  43.24 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  44.51 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  44.93 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  44.93 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  46.58 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 396 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 407 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  44.32 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 415 aa  303  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  44.54 
 
 		 391 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 411 aa  300  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  43.56 
 
 		 393 aa  296  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  28.72 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  25.48 
 
 		 396 aa  126  8.000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  27.35 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  28.92 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  21.97 
 
 		 396 aa  43.1  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>