43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2176 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 398 aa  801    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  96.23 
 
 		 398 aa  733    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  59.07 
 
 		 388 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  48.19 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  50.93 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  49.45 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  49.21 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  48.81 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 380 aa  345  8e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 383 aa  338  9e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 405 aa  279  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 412 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  39.08 
 
 		 401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  37.89 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  40.22 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 415 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 		 402 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  36.18 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 402 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 402 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 430 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 411 aa  252  7e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  39.94 
 
 		 395 aa  249  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  36.22 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 401 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  39.23 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 401 aa  242  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 396 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  29.85 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  26.87 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  24.86 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  28.57 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>