41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1648 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
395 aa  790    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  46.07 
 
 
399 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  47.09 
 
 
396 aa  328  8e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  39.59 
 
 
398 aa  290  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  31.23 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  30.63 
 
 
380 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  30.53 
 
 
382 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  30 
 
 
383 aa  142  8e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  28.61 
 
 
393 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  28.17 
 
 
388 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  29.21 
 
 
401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  28.25 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  27.68 
 
 
396 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 
378 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  29.64 
 
 
392 aa  133  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
409 aa  133  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  27.6 
 
 
401 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  27.3 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  29.12 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  26.16 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  27.42 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  28.31 
 
 
393 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  26.71 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  26.71 
 
 
402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
402 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  26.41 
 
 
430 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  27.43 
 
 
391 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  27.45 
 
 
396 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  27.47 
 
 
411 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
385 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
388 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  27.3 
 
 
407 aa  123  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  25.13 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  24.93 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  25.07 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  26.95 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  27.54 
 
 
415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  26.43 
 
 
405 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 
398 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
388 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 
398 aa  86.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>