41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0809 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  100 
 
 		 407 aa  823    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  80.26 
 
 		 430 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  80.26 
 
 		 402 aa  630  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  80.26 
 
 		 402 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  80.52 
 
 		 402 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  78.89 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  78.53 
 
 		 388 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  79.59 
 
 		 391 aa  624  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  76.84 
 
 		 395 aa  619  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  78.91 
 
 		 401 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  78.91 
 
 		 401 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  78.12 
 
 		 401 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  77.17 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  70.24 
 
 		 412 aa  588  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  67.37 
 
 		 410 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  64.46 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  59.95 
 
 		 393 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  57.55 
 
 		 392 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  58.36 
 
 		 393 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  54.78 
 
 		 405 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  59.19 
 
 		 401 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  51.85 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  51.7 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 		 409 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 411 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  43.12 
 
 		 382 aa  315  6e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 380 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 385 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  43.56 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 		 388 aa  296  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  40.63 
 
 		 383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 		 378 aa  279  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  42.34 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 398 aa  235  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  30.23 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  26.4 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  26.53 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 395 aa  123  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  27.25 
 
 		 396 aa  99.8  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>