42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0958 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  829    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  67.73 
 
 		 409 aa  567  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  68.06 
 
 		 411 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  54.17 
 
 		 393 aa  411  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  54.17 
 
 		 392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  54.95 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  51.17 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  51.7 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  51.93 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  51.43 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  51.69 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  51.43 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  51.17 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  50.9 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  51.02 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  51.81 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 412 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  52.47 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  47.41 
 
 		 410 aa  356  5e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  48.12 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  49.22 
 
 		 401 aa  352  5.9999999999999994e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 397 aa  348  8e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 398 aa  344  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  42.71 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 388 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  42.18 
 
 		 385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 382 aa  272  9e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 380 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 383 aa  260  4e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  38.69 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 398 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  28.26 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  25.19 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  26.2 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  24.86 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>