48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2940 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 378 aa  756    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  60.7 
 
 		 385 aa  461  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  61.25 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  54.99 
 
 		 391 aa  418  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  48.66 
 
 		 383 aa  397  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  49.05 
 
 		 380 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  48.51 
 
 		 382 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  50.93 
 
 		 398 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  50.4 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 398 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  51.38 
 
 		 388 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  45.38 
 
 		 392 aa  331  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  44.74 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 396 aa  315  8e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 405 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  43.73 
 
 		 393 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 395 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 401 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  42.9 
 
 		 402 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  42.9 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  42.9 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  42.9 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  45.13 
 
 		 410 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  44.27 
 
 		 393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 388 aa  306  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 412 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  46.38 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  41.64 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 		 409 aa  292  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 391 aa  292  7e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 415 aa  282  6.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 411 aa  282  8.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  28.24 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  27.95 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  30.51 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  26.39 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  24.57 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  24.57 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  20.69 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 438 aa  43.9  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  19.92 
 
 		 406 aa  42.7  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>