41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2491 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  798    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  57.33 
 
 		 412 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  57.78 
 
 		 392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  56.06 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  55.81 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  56.31 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  55.42 
 
 		 430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  57.11 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  56.99 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  57.26 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  56.67 
 
 		 396 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  55.81 
 
 		 401 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  56.95 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  55.93 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  54.78 
 
 		 407 aa  433  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  56.99 
 
 		 391 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  55.44 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  53.7 
 
 		 410 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  56.46 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  53.83 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  58.33 
 
 		 398 aa  411  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  50.77 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  51.17 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  52.3 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  50.65 
 
 		 411 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  46.58 
 
 		 385 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  45.74 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  44.56 
 
 		 388 aa  301  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 		 378 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 382 aa  299  5e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  43.87 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  42.02 
 
 		 398 aa  266  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  44.41 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  26.78 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 395 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  24.81 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  24.51 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  27.99 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>