43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0674 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  81.72 
 
 		 395 aa  646    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  100 
 
 		 388 aa  780    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  79 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  81.61 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  78.53 
 
 		 407 aa  627  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  80.05 
 
 		 402 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  79.95 
 
 		 401 aa  617  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  80.36 
 
 		 401 aa  614  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  79.79 
 
 		 402 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  79.53 
 
 		 402 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  79.53 
 
 		 430 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  79.02 
 
 		 401 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  75.32 
 
 		 412 aa  598  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  77.02 
 
 		 391 aa  589  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  65.45 
 
 		 410 aa  510  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  64.74 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  59.21 
 
 		 393 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  57.63 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  56.58 
 
 		 393 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  56.95 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  60.22 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  54.4 
 
 		 398 aa  398  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  51.57 
 
 		 409 aa  388  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  51.93 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  51.05 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  44.89 
 
 		 385 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  45.75 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 382 aa  301  9e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  46.24 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  44.57 
 
 		 378 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  43.33 
 
 		 391 aa  279  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 		 388 aa  245  8e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  28.24 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  29 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  26.22 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  27.71 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>