70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2914 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  98.59 
 
 		 425 aa  850    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  100 
 
 		 425 aa  860    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  99.53 
 
 		 425 aa  856    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  78.42 
 
 		 427 aa  668    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  98.82 
 
 		 425 aa  851    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  99.06 
 
 		 425 aa  855    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  99.29 
 
 		 425 aa  854    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  98.59 
 
 		 425 aa  850    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  98.82 
 
 		 425 aa  851    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 419 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  30.18 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  28.88 
 
 		 422 aa  196  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 421 aa  160  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  26.63 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 448 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 421 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  26.37 
 
 		 421 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 421 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 421 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  26.37 
 
 		 421 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  27.38 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 440 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  24.23 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 214 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 433 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  24.23 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  24.25 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 425 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 425 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6462  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 453 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320121  hitchhiker  0.0000481514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  23.02 
 
 		 497 aa  49.3  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  22.56 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  22.54 
 
 		 483 aa  47  0.0007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  25 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  24.81 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  22.01 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  21.93 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38823  MFS family transporter: phosphate/sugar  21.93 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.726317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  23.83 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  23.83 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  25 
 
 		 409 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  22.82 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  20.36 
 
 		 422 aa  43.5  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  23.48 
 
 		 430 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  21.68 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 413 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 421 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>