More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6462 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6462  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 453 aa  923    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320121  hitchhiker  0.0000481514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 435 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  32.85 
 
 		 448 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.59 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 425 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  28.5 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  28.5 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  29.81 
 
 		 436 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  28.5 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  28.5 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  31.23 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  28.22 
 
 		 430 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 442 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  27.74 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  27.74 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  27.74 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  27.74 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  27.74 
 
 		 445 aa  170  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  27.74 
 
 		 445 aa  170  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  28.38 
 
 		 450 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0010  d-galactonate transporter  28.1 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.661181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  27.49 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  27.69 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 428 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 436 aa  166  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  29.46 
 
 		 424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 452 aa  163  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 449 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 440 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  26.5 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 467 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  27.23 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 440 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 440 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  28.29 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  26.15 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  27.59 
 
 		 446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 453 aa  156  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  27.59 
 
 		 446 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 440 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  27.53 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  24.6 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  25.98 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  26.01 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  27.7 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  26.88 
 
 		 436 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 439 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  26.11 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  26.11 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  26.11 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  25.82 
 
 		 454 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  25.82 
 
 		 454 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  26.11 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  26 
 
 		 479 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 446 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  26.05 
 
 		 428 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 428 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 464 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  27.06 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.35 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  27.7 
 
 		 453 aa  150  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 453 aa  150  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>