92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3580 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  76.96 
 
 		 421 aa  660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  77.43 
 
 		 421 aa  663    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  77.43 
 
 		 421 aa  663    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  841    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  76.96 
 
 		 421 aa  661    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  77.43 
 
 		 421 aa  664    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  77.43 
 
 		 421 aa  663    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  77.43 
 
 		 421 aa  663    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  77.43 
 
 		 421 aa  663    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  37.44 
 
 		 428 aa  270  5e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 419 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  57.71 
 
 		 207 aa  247  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  31.88 
 
 		 422 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  27.21 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  27.21 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  26.97 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  26.49 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  26.97 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  26.49 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 214 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  27.4 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  27.83 
 
 		 417 aa  149  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 448 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  25.3 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  24.65 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  24.35 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  24.93 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0206  sugar phosphate antiporter  28.26 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0212  sugar phosphate antiporter  28.26 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  24.64 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  24.5 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  24.64 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  24.64 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  24.64 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  24.64 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  24.64 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  23.79 
 
 		 497 aa  57.4  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  21.93 
 
 		 455 aa  57  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  21.93 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1683  hypothetical protein  36.71 
 
 		 82 aa  53.1  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  24.26 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  24.26 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  23.99 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  23.99 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  23.99 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3502  regulatory protein UhpC  24.8 
 
 		 447 aa  50.4  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 		 437 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  22.03 
 
 		 483 aa  50.4  0.00006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  23.75 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  21.92 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  23.85 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  22.87 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.85 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  21.4 
 
 		 433 aa  47  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 421 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.28 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  23.75 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94723  MFS family transporter: glycerol-3-phosphate  23.05 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000449836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0033  sugar phosphate antiporter  28.16 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4174  sugar phosphate antiporter  28.16 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0037  phosphoglycerate transporter  28.16 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03492  hypothetical protein  28.16 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  22.52 
 
 		 456 aa  44.3  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4253  sugar phosphate antiporter  28.11 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3879  sugar phosphate antiporter  28.16 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  24.83 
 
 		 481 aa  44.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000061877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5096  sugar phosphate antiporter  28.16 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0505973 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4031  sugar phosphate antiporter  28.16 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.505576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03550  sugar phosphate antiporter  28.16 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  23.77 
 
 		 449 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0030  sugar phosphate antiporter  29.86 
 
 		 463 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.668761 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  24.22 
 
 		 449 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  23.04 
 
 		 436 aa  43.1  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  24.22 
 
 		 449 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2103  major facilitator transporter  20.7 
 
 		 449 aa  43.1  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.552492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  23.59 
 
 		 449 aa  43.1  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>