86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0534 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  100 
 
 
391 aa  768    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  23.25 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  23.22 
 
 
395 aa  67  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  23.51 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  24.02 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  24.02 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  23.74 
 
 
400 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  26.07 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  21.15 
 
 
386 aa  60.1  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  27.32 
 
 
436 aa  59.7  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  22.69 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1959  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0139885  hitchhiker  0.0025051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 
388 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  22.91 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  27.27 
 
 
428 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0010  major facilitator transporter  23.82 
 
 
376 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
384 aa  53.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
385 aa  53.1  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  21.17 
 
 
505 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  26.47 
 
 
394 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  22.35 
 
 
417 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 
433 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  27.34 
 
 
424 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03949  osmolarity sensor protein  26.33 
 
 
392 aa  50.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  23.96 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  23.96 
 
 
394 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  23.96 
 
 
394 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  25.58 
 
 
421 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
390 aa  49.7  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  23.05 
 
 
404 aa  49.7  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1347  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 
410 aa  49.7  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.258837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  18.56 
 
 
392 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  25.92 
 
 
415 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  30.62 
 
 
427 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1460  major facilitator transporter  28.37 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  21.9 
 
 
529 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  25.57 
 
 
420 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  26.53 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 
371 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  26.17 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  22.07 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  26.39 
 
 
379 aa  47.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  32.17 
 
 
415 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  25.39 
 
 
415 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  31.54 
 
 
437 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  24.93 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  24.93 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  24.93 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  25.12 
 
 
417 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  24.93 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  34.21 
 
 
415 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  26.5 
 
 
391 aa  47  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  22.55 
 
 
414 aa  46.6  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  26.14 
 
 
420 aa  46.6  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
407 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  21.99 
 
 
397 aa  46.2  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  29.73 
 
 
431 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  24.35 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  28.77 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  29.1 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  25.73 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  25 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
451 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  27.66 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  29.41 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  27.66 
 
 
423 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  27.97 
 
 
426 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  27.61 
 
 
410 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  20.34 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  21.15 
 
 
393 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  20.85 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  25.58 
 
 
390 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  24.03 
 
 
440 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.44 
 
 
487 aa  43.5  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  28.16 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  29.96 
 
 
410 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
451 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  24.49 
 
 
423 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  23.4 
 
 
397 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
407 aa  43.1  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  20.49 
 
 
402 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>