60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3954 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  86.29 
 
 		 394 aa  701    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  99.47 
 
 		 380 aa  758    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  99.75 
 
 		 394 aa  790    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3791  hypothetical protein  74.74 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  75.06 
 
 		 393 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3560  hypothetical protein  74.55 
 
 		 393 aa  598  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3833  hypothetical protein  74.81 
 
 		 393 aa  598  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0348  hypothetical protein  74.55 
 
 		 393 aa  598  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4675  hypothetical protein  74.81 
 
 		 393 aa  599  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.398829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0348  major facilitator superfamily MFS_1  74.81 
 
 		 393 aa  598  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03215  hypothetical protein  74.3 
 
 		 393 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3740  hypothetical protein  74.3 
 
 		 393 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  75.06 
 
 		 393 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3778  hypothetical protein  74.81 
 
 		 393 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.974681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  75.06 
 
 		 393 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  74.55 
 
 		 393 aa  594  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03167  hypothetical protein  74.3 
 
 		 393 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  74.55 
 
 		 393 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  72.96 
 
 		 397 aa  586  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  70.66 
 
 		 398 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2271  hypothetical protein  66.5 
 
 		 393 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2681  hypothetical protein  24.86 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  hitchhiker  0.00146512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3272  hypothetical protein  24.64 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2502  hypothetical protein  23.4 
 
 		 394 aa  137  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.156303  hitchhiker  0.000706101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1658  hypothetical protein  23.54 
 
 		 384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0600351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3423  hypothetical protein  24.71 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1839  hypothetical protein  24.4 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157174  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2718  hypothetical protein  23.54 
 
 		 384 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 422 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3785  hypothetical protein  22.28 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  24.63 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  24.63 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  24.63 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  24.63 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  24.63 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  21.96 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  21.61 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  21.61 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  20.68 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  24.44 
 
 		 421 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  24.44 
 
 		 421 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 421 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  21.37 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1907  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  24.44 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.197436 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  20.16 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  21.93 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  19.84 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2184  permease  20.36 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0066  major facilitator superfamily permease  20.42 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.110022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2189  putative transport system permease protein  20.78 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>