74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0275 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 371 aa  708    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  28.93 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  23.44 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0483  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  28.22 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  26.4 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  25.5 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  26.32 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  24.83 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  25.1 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  27.04 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  27.81 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  26.09 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  25.97 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  29.3 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 386 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  25.7 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  25.84 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  26.88 
 
 		 437 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  22.45 
 
 		 529 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  23.02 
 
 		 414 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 393 aa  53.5  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  24.1 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  23.3 
 
 		 274 aa  53.1  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  23.74 
 
 		 419 aa  52.8  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  23.24 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  23.65 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0250  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.651007  normal  0.954901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  25.12 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  26.16 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  25.18 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  25.45 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  25.45 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  25.45 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  25.45 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 392 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0010  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 376 aa  49.7  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  24.85 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  24.54 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  23.21 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  23.57 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  23.64 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  23.57 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  23.64 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  24.29 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 420 aa  46.2  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  24.24 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  27.33 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  27.33 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  23.48 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  24.73 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  29.27 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  26.88 
 
 		 403 aa  43.5  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3272  hypothetical protein  24.92 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0750  fucose permease  24.1 
 
 		 424 aa  43.5  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000880356  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  23.64 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  23.64 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  25.15 
 
 		 424 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  23.26 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  25.93 
 
 		 415 aa  43.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  24.71 
 
 		 468 aa  42.7  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>