36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_3279 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  778    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  778    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  99.75 
 
 
400 aa  778    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  23.78 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  27.49 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  26.91 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  20.93 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 
388 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  26.57 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  24.02 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 
407 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  29.77 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  24.24 
 
 
419 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  21.88 
 
 
395 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  21.64 
 
 
440 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  28.73 
 
 
406 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  30.23 
 
 
434 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  20.58 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  28.68 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  26.32 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  21.73 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  28.68 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  23.05 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  28.68 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  28.68 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  27.48 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  29.46 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  29.46 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
391 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  28.68 
 
 
432 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  28.68 
 
 
432 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  28.68 
 
 
432 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  24.76 
 
 
389 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  29.13 
 
 
435 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  22.35 
 
 
507 aa  43.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>