54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3713 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  86.54 
 
 
394 aa  672    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  763    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  99.47 
 
 
394 aa  758    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  99.74 
 
 
394 aa  761    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3791  hypothetical protein  74.8 
 
 
394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  74.27 
 
 
397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  74.67 
 
 
393 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0348  hypothetical protein  74.14 
 
 
393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4675  hypothetical protein  74.41 
 
 
393 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.398829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0348  major facilitator superfamily MFS_1  74.41 
 
 
393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3560  hypothetical protein  74.14 
 
 
393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3833  hypothetical protein  74.41 
 
 
393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3778  hypothetical protein  74.4 
 
 
393 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.974681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  74.67 
 
 
393 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3740  hypothetical protein  73.88 
 
 
393 aa  569  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  74.67 
 
 
393 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03167  hypothetical protein  73.88 
 
 
393 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03215  hypothetical protein  73.88 
 
 
393 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  74.13 
 
 
393 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  74.13 
 
 
393 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  71.88 
 
 
398 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2271  hypothetical protein  66.31 
 
 
393 aa  508  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2681  hypothetical protein  25.14 
 
 
405 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  hitchhiker  0.00146512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3272  hypothetical protein  24.61 
 
 
392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2502  hypothetical protein  23.01 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.156303  hitchhiker  0.000706101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1658  hypothetical protein  23.16 
 
 
384 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0600351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3423  hypothetical protein  24.61 
 
 
392 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1839  hypothetical protein  24.07 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157174  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2718  hypothetical protein  23.16 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 
422 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3785  hypothetical protein  22.1 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  24.44 
 
 
411 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  24.44 
 
 
411 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  24.44 
 
 
411 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  24.44 
 
 
411 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  24.44 
 
 
411 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  21.96 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  23.96 
 
 
391 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  23.11 
 
 
415 aa  50.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  21.61 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  21.61 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 
385 aa  46.6  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  21.14 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  20.16 
 
 
393 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  21.93 
 
 
405 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  21.64 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  23.95 
 
 
426 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  24.25 
 
 
421 aa  43.1  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  24.25 
 
 
421 aa  43.1  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  24.25 
 
 
421 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 
421 aa  43.1  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  24.25 
 
 
421 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  24.25 
 
 
423 aa  42.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  24.25 
 
 
421 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.197436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>