36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2502 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2718  hypothetical protein  91.88 
 
 		 384 aa  690    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2502  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  782    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.156303  hitchhiker  0.000706101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1658  hypothetical protein  90.58 
 
 		 384 aa  685    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0600351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1839  hypothetical protein  90.79 
 
 		 391 aa  691    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157174  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3272  hypothetical protein  78.8 
 
 		 392 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3423  hypothetical protein  78.22 
 
 		 392 aa  607  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3785  hypothetical protein  77.58 
 
 		 390 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2681  hypothetical protein  25.51 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  hitchhiker  0.00146512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  23.4 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2271  hypothetical protein  24.16 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  23.4 
 
 		 394 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  23.32 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  23.01 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  23.67 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  23.94 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  23.67 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  23.94 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  21.71 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0348  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3778  hypothetical protein  23.67 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.974681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3833  hypothetical protein  24.13 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0348  hypothetical protein  23.86 
 
 		 393 aa  126  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3740  hypothetical protein  23.86 
 
 		 393 aa  126  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3560  hypothetical protein  23.86 
 
 		 393 aa  126  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  24.4 
 
 		 393 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4675  hypothetical protein  24.13 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.398829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03167  hypothetical protein  23.86 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03215  hypothetical protein  23.86 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  22.66 
 
 		 398 aa  117  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3791  hypothetical protein  23.19 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  19.67 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  24.29 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>