63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4675 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0348  major facilitator superfamily MFS_1  99.75 
 
 		 393 aa  787    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03167  hypothetical protein  98.98 
 
 		 393 aa  782    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4675  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  789    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.398829 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  91.35 
 
 		 393 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  90.84 
 
 		 393 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  91.09 
 
 		 393 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3778  hypothetical protein  91.09 
 
 		 393 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.974681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  90.84 
 
 		 393 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3740  hypothetical protein  98.98 
 
 		 393 aa  781    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  99.75 
 
 		 393 aa  788    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0348  hypothetical protein  99.24 
 
 		 393 aa  784    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3833  hypothetical protein  99.75 
 
 		 393 aa  787    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3560  hypothetical protein  99.24 
 
 		 393 aa  784    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3791  hypothetical protein  87.5 
 
 		 394 aa  697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03215  hypothetical protein  98.98 
 
 		 393 aa  782    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  76.08 
 
 		 394 aa  601  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  74.81 
 
 		 394 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  74.81 
 
 		 394 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  74.41 
 
 		 380 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  69.57 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2271  hypothetical protein  67.59 
 
 		 393 aa  536  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  67.01 
 
 		 398 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2681  hypothetical protein  26.49 
 
 		 405 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  hitchhiker  0.00146512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3423  hypothetical protein  24.23 
 
 		 392 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3272  hypothetical protein  25.45 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2502  hypothetical protein  24.13 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.156303  hitchhiker  0.000706101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1658  hypothetical protein  25.13 
 
 		 384 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0600351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 422 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3785  hypothetical protein  23.21 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2718  hypothetical protein  24.6 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1839  hypothetical protein  23.47 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157174  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  25.62 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  26.1 
 
 		 424 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  21.93 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  23.02 
 
 		 411 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  23.02 
 
 		 411 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  23.02 
 
 		 411 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  23.02 
 
 		 411 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  23.02 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  20.38 
 
 		 425 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  24.01 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  23.76 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  21.6 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  23.35 
 
 		 449 aa  46.6  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  21.6 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  25.67 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  24.41 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  31.13 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  21.63 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  31.25 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  28.19 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  21.1 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  37.04 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2463  MFS transporter  24.88 
 
 		 431 aa  43.5  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  25.84 
 
 		 412 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  25.95 
 
 		 426 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  25.32 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.8 
 
 		 462 aa  43.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.711123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>